制定健全各项高效运转的管理制度：在国家863计划大气光学重点实验室运行的基础上，按照规定修订各项管理制度，包括实验室安全、科研装备和基础设施维护、课题财务等，具有良好的可操作性，保证实验室科研工作高效、规范运转。

建立开放流动的人员选聘机制：实验室实行开放、竞争、流动的机制，根据科研任务的需要实行岗位聘用制，各类人员进行公开竞聘和招聘，坚持能者上庸者下的用人制度；同时，利用实验室调控资源，稳定支持开展一些需要较长期坚持的重要基础性和探索性研究工作；为吸引高素质的优秀科研人员营造良好的氛围和宽松的环境。

健全激励的分配制度：为保障实验室按质按量完成各项科研任务，促进多出成果、多出人才，根据国家和科学院有关制度，根据科研人员所在岗位的重要性和科研产出，制定并执行岗位绩效奖励制度。

科研项目管理：为保证实验室科研项目的顺利实施，高效利用有限宝贵的科研资金，实验室在项目执行中，按照质量管理体系原则实行过程动态管理，做到每一个项目和项目的每一个环节都有专人管理，全程跟踪的项目管理，及时总结、早发现问题早解决、确保每一个项目高质量高水平按期完成。

仪器设备运行管理：为充分发挥大型仪器效能，提高使用效率，大型仪器设备实行统一管理、对外开放、资源共享，部分仪器设备进入中科院和安徽省大型仪器协作网，对外开放使用。由经过培训的专人负责仪器设备的检验调试、运行维护，制定仪器设备的操作规程，建立技术和维护档案。

大气探测系统的常规观测运行：不断完善测量系统，尽可能配备各种测量设备，坚持对大气成分等参数的常规观测运行，对边界层、对流层、平流层和中层大气，包括地面和整层大气，进行综合、长期、规范的测量。考虑到实验观测的长期性，建立一支精干的实验观测小组，并实行值班员责任制，确保观测数据的规范性和完整性。